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假丝酵母属菌种资源描述规范

假丝酵母属菌种资源描述规范

起草单位:中国食品发酵工业研究院

目    次

前    言............................................................................... 3

引    言............................................................................... 4

1 范围................................................................................. 5

2 规范性引用文件....................................................................... 5

3 术语和定义........................................................................... 5

4 要求................................................................................. 5

5 描述内容............................................................................. 6

参考文献......................................................................................................................................... 10

附表A 国家自然科技资源平台假丝酵母属菌种资源描述表.................................... 11

 

 

前    言

本规范由国家自然科技资源平台建设项目提出。

本规范起草单位:中国农业科学院农业资源与农业区划研究所、中国科学院微生物研究所、中国林业科学研究院森林保护研究所、中国药品生物制品检定所、中国医学科学院医药生物技术研究所、中国兽医药品监察所、中国食品发酵工业研究院。

本规范主要起草人:程池、李金霞、姚粟、姜瑞波、顾金刚、周宇光、朴春根、叶强、张月琴、陈敏等。

 

引    言

假丝酵母属是子囊菌酵母的一个无性型属,也是酵母菌中最大的一个属。已被承认的种多达165种,约占已知酵母菌总数(约100个属,700多个种)的四分之一,其中许多种与人类疾病有关,如Candida albicans是寄生在人体或其他恒温动物的口腔、肠胃和泌尿生殖系统中的一类专性内生菌,可引起阴道炎、皮炎、膀胱炎、肌炎、肝功能失调、精神混乱以及发热等疾病。有一些假丝酵母也具有重要的工业用途:如Candida utilis常被用来生产饲料酵母作为动物饲料蛋白添加剂,Candida norvegensis能够利用半乳糖产生维生素C,Candida zeylaniodesCandida citrica能够利用植物油或葡萄糖生产柠檬酸等。

制定本规范是为了规范假丝酵母属菌种资源描述标准,便于假丝酵母属菌种资源的收集、保存、鉴定、评价、研究和利用,有效整理菌种资源,促进菌种资源信息化,实现菌种资源的高效共享和可持续利用。

 

假丝酵母属菌种资源描述规范

1 范围

本规范规定了假丝酵母属菌种资源的描述要素和描述规范。

本规范适用于假丝酵母属菌种资源的收集、整理和保藏,以及数据库和信息共享网络系统的建立。

2 规范性引用文件

下列文件中的条款通过本规范的引用而成为本规范的条款。凡是注日期的引用文件,其随后所有的修改单(不包括勘误的内容)或修订版均不适用于本规范,然而,鼓励根据本规范达成协议的各方研究是否可使用这些文件的最新版本。凡是不注日期的引用文件,其最新版本适用于本规范。

《病原微生物实验室生物安全管理条例》

科技部自然科技资源平台联合管理办公室文件《自然科技资源共性描述规范》

3 术语和定义

下列术语和定义适用于本规范。

3.1  

假丝酵母属 Candida

假丝酵母属菌种细胞呈球形、椭圆形、柱形或长形,偶尔呈S形、三角形或新月形。繁殖方式为全壁芽殖。可形成假菌丝和有隔菌丝。细胞壁为子囊菌的双层结构。不产生节孢子和掷孢子。不产生类淀粉化合物。重氮基蓝B(DBB)反应为阴性。细胞壁水解产物中不含木糖、鼠李糖和海藻糖。

3.2 分类地位为:子囊菌门(Ascomycota)、半子囊菌纲(Hemiascomycetes)、酵母菌目(Saccharomycetales)、假丝酵母菌科(Candidaceae)、假丝酵母属(Candida)。

模式种为Candida vulgaris Berkhout[同物异名:Candida tropicalis(Castellani) Berkhout]。

3.3 

芽殖 budding

即出芽繁殖,指在酵母菌细胞表面产生小的突起,形成小芽,并增大形成子细胞,随后脱离母细胞而形成新的细胞。

3.4  

假菌丝 pseudohypha

指酵母菌菌种进行一连串的芽殖后,长大的子细胞仍不脱落分离,细胞成串排列,形成类菌丝状,在分隔处缢缩。

3.5  

全壁芽殖 holoblastic budding

指母细胞的内、外细胞壁全部参与芽细胞内外细胞壁的形成,母细胞和子细胞的细胞外壁是连续的。

4 要求

4.1 描述要求:

—— 描述内容应清楚、准确,力求完整;

—— 要充分考虑该菌株的最新研究进展;

—— 能被微生物专业人员理解。

4.2 描述要素

描述要素分为2类:

—— M:必备要素,必须描述的要素;

—— O:可选要素,其描述与否视具体菌株而定。

4.3 按描述内容所列条目的要求逐项填写附录A表。

5 描述内容

5.1 基本信息

5.1.1 学名(M)

应指明该菌株完整的科学名称。对于鉴定到属、未鉴定到种的菌株,以“Candida sp.”表示。

5.1.2 中文名称(M)

应指明该菌株的中文名称(如有别名,可在括号中注明)。尚无中文译名时,填写“暂无”。

5.1.3 资源归类编码(M)

假丝酵母属的资源归类编码为15151111103,参见《自然科技资源共性描述规范》。

5.1.4 菌株保藏编号(M)

应指明该菌株在专业保藏机构的保藏编号。保藏编号由前缀和菌株编号两部分组成。前缀为保藏机构英文名称的缩写,前缀和菌株编号之间应留空格。

5.1.5 其他保藏中心编号(O)

宜指明该菌株在其他菌种保藏中心的保藏编号。其他保藏中心编号前以等号“=”开头,保藏编号之间用等号“=”连接。

5.1.6 来源历史(M)

应指明该菌株在收藏单位之间的转移情况。收藏单位前以左指向箭头“←”开头,收藏单位之间用左指向箭头“←”连接。

5.1.7 分离人(O)

应指明该菌株最初分离人的姓名。

5.1.8 分离时间(O)

宜指明该菌株的分离时间。格式为YYYYMMDD,其中YYYY为年,MM为月,DD为日。

5.1.9 原始编号(O)

宜指明该菌株原始分离编号。

5.1.10 鉴定人(O)

宜指明该菌株的鉴定人。

5.1.11 鉴定人所在单位(O)

宜指明该菌株的鉴定人所在单位。

5.1.12 收藏时间(O)

宜指明保藏机构收集、保存该菌株的时间。格式为YYYYMMDD,其中YYYY为年,MM为月,DD为日。

5.1.13 原产国或地区(O)

应指明该菌株分离基物采集地所在国家或地区名称。

5.1.14 采集地(O)

宜指明该菌株分离基物的采集地区和采集地点。采集地区详细到县。

5.1.15 分离基物(O)

宜指明该菌株具体的分离物质。

5.1.16 采集地生境(O)

宜描述该菌株分离基物采集地的具体生态环境。参照《微生物菌种资源采集环境描述规范》。

5.1.17 生物危害程度(M)

应指明该菌株的生物危害程度。参照《病原微生物实验室生物安全管理条例》将微生物分为:

1:一类;

2:二类;

3:三类;

4:四类;

5:不清楚。

5.1.18 致病对象(M)

应指明该菌株的致病对象类群。包括:

1:无;

2:人类;

3:动物;

4:人畜共患;

5:植物;

6:微生物;

7:不清楚。

5.1.19 致病名称(O)

应指明该菌种能够引起的疾病名称及感染的组织部位。

5.1.20 传播途径(O)

传播途径主要包括:

1:接触;

2:空气;

3:食物;

4:水;

5:血液;

6:其他。

5.1.21 培养基编号(M)

应指明该菌株最适培养基的统一编号。统一编号由前缀和培养基编号两部分组成。前缀为统一培养基编号的英文缩写CM,编号以4位数表示,前缀和编号之间不留空格。培养基的统一编号参考《中国菌种目录》。

5.1.22 培养温度 (M)

应指明该菌株生长的最适温度,以℃表示。

5.1.23 模式菌株(M)

应指明该菌株是否为模式菌株,其中模式菌株包括当前承认种的模式和异名的模式。

1:模式菌株;

2:非模式菌株。

5.1.24 分类地位 (O)

应指明该菌株的的界、门、纲、目、科、属、种。

如需要,可指明该菌株的变种、亚种名等。

5.2 特征特性信息

5.2.1 液体培养特征

5.2.1.1 液体标准培养条件(M)

假丝酵母属菌种的液体培养特征形态描述应在标准培养条件下培养并描述,并在描述时注明采用标准培养基名称。标准培养条件包括标准培养基、培养温度及培养时间。标准培养基有:葡萄糖-蛋白胨-酵母提取物液体培养基(glucose-peptone-yeast extract broth);麦芽汁培养基(malt extract broth);YM培养基(YM broth)。培养温度为:25℃。培养时间为:2~3天。

5.2.1.2 细胞形态(M)

应指明细胞的形态,包括球形、卵圆形、椭圆形、柱形、长形、S形、三角形、新月形等。

5.2.1.3 细胞大小(O)

应指明该菌株单个营养细胞的大小,并以“宽×长”表示,单位为微米(mm)。

5.2.1.4 宏观特征(M)

    应指明该菌株液体培养时容器底部有无沉淀及其质地,培养液是否混浊,表面是否产生菌环、菌璞或岛状璞。如产生菌璞,则应观察其为干燥或湿润;表面是否光滑,是否有光泽或褶皱;以及是否沿试管壁向上生长等。

5.2.2 固体培养特征

  1. 5.2.2.1     固体标准培养条件(M)

假丝酵母属菌种的固体培养特征形态描述应在标准培养条件下培养并描述,标准培养条件包括标准培养基、培养温度及培养时间。标准培养基有:葡萄糖-蛋白胨-酵母提取物培养基(glucose-peptone-yeast extract agar);麦芽汁琼脂(malt extract agar);YM琼脂培养基(YM agar)。培养温度为:25℃。培养时间为:1~7天。

  1. 5.2.2.2     菌落质地(M)

应指明该菌株在固体培养基上形成的菌落的质地:是否为奶酪状、黏液状、松脆状或坚韧状。

  1. 5.2.2.3     菌落颜色(M)

应指明该菌株在固体培养基上形成的菌落的颜色以及菌落底部颜色,常为乳白色或奶油色,但注意是否有黄色,橙色,棕色或红色等色调。

  1. 5.2.2.4     菌落特征(M)

应指明该菌株在固体培养基上形成的菌落的特征,包括:

—— 菌落表面是否反光或暗淡,是否光滑或粗糙,是否有条纹、皱褶,是否有疣状或脊状突起以及是否产生毛发样突起等;

—— 菌落边缘是否平滑(全缘),是否呈波浪状、裂叶状、蚀刻状、根状、流苏状或须状;

—— 菌落是平伏还是隆起。

5.2.3 假菌丝(O)

宜指明该菌株在特定的条件下是否形成假菌丝。

5.2.4 繁殖方式

5.2.4.1无性繁殖方式(M)

应指明该菌株进行无性繁殖的方式。

5.2.4.2 芽殖方式(O)

宜指明该菌株芽殖的方式,包括多边芽殖,两端芽殖或单端芽殖。

5.2.5生理生化特性

5.2.5.1糖类发酵试验(O)                          

宜指明该菌株对7种糖的发酵能力。这7种糖分别为葡萄糖(glucose)、半乳糖(galactose)、蔗糖(sucrose)、麦芽糖(maltose)、乳糖(lactose)、棉子糖(raffinose)和海藻糖(trehalose)。

5.2.5.2碳源同化实验(O)

宜指明该菌株在好氧条件下对不同碳源的利用情况,包括:

—— 六碳糖:葡萄糖(glucose)、半乳糖(galactose)、L-山梨糖 (L-sorbose);

—— 五碳糖:D-木糖(D-xylose)、L-阿拉伯糖(L-arabinose)、D-阿拉伯糖(D-arabinose)、D-核糖(D-ribose)、L-鼠李糖(L-rhamnose);

—— 双糖:蔗糖(sucrose)、麦芽糖(maltose)、纤维二糖(cellobiose)、海藻糖(trehalose) 、乳糖(lactose)、蜜二糖(melibiose);

—— 三糖:棉子糖(raffinose)、松三糖(melezitose);

—— 多糖:可溶性淀粉(soluble starch);

—— 醇类:、赤藓糖醇(erythritol)、核糖醇(ribitol)、D-甘露醇(D-mannitol)、肌醇(inositol)、甘油(glycerol)、半乳糖醇(galactitol)、D-山梨醇(D-glucitol or sorbitol)、乙醇(ethanol);

—— 有机酸:琥珀酸(succinic acid)、柠檬酸(citric acid)、DL-乳酸(DL-lactic acid);

—— 糖苷:水杨苷(salicin)。

5.2.5.3 氮源同化实验(O)

宜指明该菌株在好氧条件下对硝酸盐(nitrate)作为唯一氮源的利用情况。

5.2.5.4无维生素培养基生长情况(O)

宜指明该菌株能否在无维生素培养基中生长。

5.2.5.5熊果苷裂解实验(O)

宜指明该菌株能否分解熊果苷。

5.2.5.6类淀粉化合物的形成(O)

宜指明该菌株能否形成胞外类淀粉化合物如类淀粉多糖等。

5.2.5.7放线菌酮抗性实验 (O)

宜指明该菌株能否在在添加0.01%或0.1%放线菌酮的培养基中生长。

5.2.5.8尿素分解实验(O)

宜指明该菌株能否产生脲酶分解尿素。

5.2.5.9 DBB试验(O)

宜指明该菌株DBB颜色反应结果是阳性还是阴性。

5.2.5.10温度实验(O)

宜指明该菌株能否在30℃、35℃、37℃和40℃条件下生长。

5.2.5.11耐高渗性(O)

宜指明该菌种在高渗培养基中能否生长及其生长特性,包括:

—— 耐糖:在含50%或60% D-葡萄糖培养基上的生长特性;

—— 耐盐:在含10%氯化钠和5%葡萄糖培养基上生长特性。

5.2.5.12耐酸性(O)

宜指明该菌株在添加了1%乙酸的培养基中能否生长及其生长特性。

5.2.6遗传信息

5.2.6.1血清型(O)

宜指明该菌株的抗原-抗体反应类型。

5.2.6.2基因元器件(O)

宜指明该菌株携带的特定用途的质粒、载体、筛选标记基因、启动子、增强子、信号肽基因等。

5.2.6.3 G+C mol%(O)

宜指明该菌株的鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)在核苷酸中的摩尔百分含量。

5.2.6.4核苷酸序列信息(O)

宜指明该菌株的核苷酸序列信息,如ITS序列信息、18S rDNA、26S rDNA等,并注明核苷酸序列注册号。

5.2.6.5 核型信息(O)

宜给出该菌株的染色体核型信息。

5.2.6.6营养缺陷型(O)

宜指明该菌株营养缺陷类型。

5.2.6.7 辅酶Q类型(O)

宜指明该菌株所含辅酶Q的类型。

5.3其他信息

5.3.1 具体用途(O)

应指明该菌株的具体用途。

5.3.2 图象信息 (O)

宜给出该菌株的菌落、细胞等图象信息,并注明所用培养基、培养时间及显微观察所用倍数等。

5.3.3 文献信息(O)

宜列出该菌株公开发表的文献资料。

5.3.4 保存方法 (M)

应指明适合该菌株长期保藏的技术方法。

 

 

 

 

 

 

参考文献

[1] Cletus P. Kurtzman, Jack W. Fell. The Yeasts, a Taxonomic Study. 4th edition. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE B. V.,1998

[2] N.J.W Kreger-van RijThe Yeasts, a Taxonomic Study . 3th edition. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE B. V., 1984

[3] J. A. BARNETT, R. W. PAYNE, D. YARROW. Yeasts: Characteristics and Identification. 3rd edition. The United  Kingdom: Cambridge University Press, 2000

[4] J. A. BARNETT, R. W. PAYNE, D. YARROW.  Yeasts: Characteristics and Identification. 1st  edition. The United  Kingdom: Cambridge University Press, 1983

[5] H.J.法夫等. 酵母菌的生活. 王民俊等译. 第二版. 贵阳: 《酿酒科技》编辑部,1984

[6] J.A.巴尼特,R.W.佩恩,D.亚罗. 酵母菌的特征与鉴定手册. 胡瑞卿译. 青岛: 青岛海洋大学出版社,1991

[7] M.T.马迪根,J.M.马丁克,J.帕克. 微生物生物学. 杨文博等译. 北京: 科学出版社,2001

[8] M.J.小佩尔扎等. 微生物学. 武汉大学微生物学教研室译. 北京: 科学出版社,1987

[9] 中国科学院微生物研究所菌种保藏手册. 北京: 科学出版社,1980

[10] 武汉大学、复旦大学生物系微生物学教研室. 微生物学. 北京: 人民教育出版社,1979

[11] 周德庆微生物学教程. 北京: 高等教育出版社,1993

[12] 岑沛霖,蔡谨. 工业微生物学. 北京: 化学工业出版,2000

[13] 无锡轻工大学微生物学. 第二版. 北京: 中国轻工业出版社,1990

[14] 诸葛健,王正祥. 工业微生物实验技术手册. 北京: 中国轻工业出版社,1994

[15] 杜连祥.  工业微生物学实验技术. 天津: 天津科学技术出版社,1992

 

附表A 国家自然科技资源平台假丝酵母属菌种资源描述表

填表日期:     年     月      日

基本信息

学名

 

中文名称

 

资源归类编码

 

菌株保藏编号

 

其他保藏中心编号

 

来源历史

 

分离人

 

分离时间

 

原始编号

 

鉴定人

 

鉴定人所在单位

 

收藏时间

 

原产国或地区

 

采集地

 

分离基物

 

采集地生境

 

生物危害程度

 

致病对象

 

致病名称

 

传播途径

 

培养基编号

 

培养温度(℃)

 

模式菌株

 

分类地位

 

特征特性信息

液体培养特征

液体标准培养条件

 

细胞形态

 

细胞大小

 

宏观特征

 

固体培养特征

固体标准培养条件

 

菌落质地

 

菌落颜色

 

菌落特征

 

假菌丝

 

繁殖方式

无性繁殖方式

 

芽殖方式

 

生理生化特性

糖类发酵实验

 

碳源同化实验

 

氮源同化实验

 

无维生素培养基生长情况

 

熊果苷裂解实验

 

类淀粉化合物的形成

 

放线菌酮抗性实验

 

尿素分解试验

 

DBB实验

 

温度试验

 

耐高渗性

 

耐酸性

 

遗传信息

血清型

 

基因元器件

 

G+C mol%

 

核苷酸序列信息

 

核型信息

 

营养缺陷型

 

辅酶Q类型

 

其他信息

具体用途

 

图像信息

 

文献信息

 

保存方法