酵母菌菌种资源数据标准
起草单位：中国食品发酵工业研究院
前 言
本规范由科学技术部农村与社会发展司提出。
本规范起草单位：中国农业科学院农业资源与农业区划研究所、中国科学院微生物研究所、中国林业科学研究院森林保护研究所、中国药品生物制品检定所、中国医学科学院医药生物技术研究所、中国兽医药品监察所、中国食品发酵工业研究院。
本规范主要起草人：程池、李金霞、姜瑞波、周宇光、朴春根、叶强、张月琴、陈敏等。
引 言
酵母菌是指那些以芽殖或裂殖方式进行无性繁殖的真菌，其营养阶段主要以单细胞状态存在，有性阶段不形成子实体的，多数为子囊菌，也有部分担子菌。酵母菌是人类最早利用的一类微生物菌种资源，广泛应用于各种酿酒、酱油、制醋、单细胞蛋白、焙烤、生物制药等领域，是微生物学研究及生物技术产业持续发展的重要基础。
制定本规范的目的是在酵母菌菌种资源描述规范和酵母菌数据质量控制规范的框架下构建酵母菌菌种资源的信息数据库，为酵母菌菌种资源的收集、整理、保藏、评价研究和共享工作服务，促进酵母菌产业的可持续性发展。
酵母菌菌种资源数据标准
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描述符 |
字段名 |
字段英文名 |
字段 类型 |
字段 长度 |
字段 小数位 |
单位 |
代码 |
代码英文名 |
例子 |
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平台资源号 |
平台资源号 |
Accession number |
文本 |
18 |
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|
菌株保藏编号 |
菌株保藏编号 |
Strain number |
文本 |
20 |
|
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|
中文名称 |
中文名称 |
Chinese name |
文本 |
30 |
|
|
|
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|
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学名 |
学名 |
Scientific name |
文本 |
50 |
|
|
|
|
|
|
|
其他保藏机构编号 |
其他保藏机构编号 |
Accession number in other collection |
文本 |
225 |
|
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|
来源历史 |
来源历史 |
Origin history |
文本 |
225 |
|
|
|
|
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|
原产国或地区 |
原产国或地区 |
Origin country or region |
文本 |
30 |
|
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|
|
|
|
采集时间 |
采集时间 |
Gathering date |
日期 |
10 |
|
|
|
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|
采集地区 |
采集地区 |
Sampling area |
文本 |
30 |
|
|
|
|
|
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|
采集地生境 |
采集地生境 |
Sampleing-habit |
文本 |
225 |
|
|
|
|
|
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|
分离人 |
分离人 |
Isolator |
文本 |
20 |
|
|
|
|
|
|
|
分离时间 |
分离时间 |
Isolate date |
日期 |
10 |
|
|
|
|
|
|
|
分离基物 |
分离基物 |
Isolation substrate |
文本 |
30 |
|
|
|
|
|
|
|
鉴定人 |
鉴定人 |
Identifier |
文本 |
50 |
|
|
|
|
|
|
|
鉴定人所在单位 |
鉴定人所在单位 |
Identification institution |
文本 |
100 |
|
|
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|
|
|
鉴定时间 |
鉴定时间 |
Identification date |
文本 |
10 |
|
|
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|
|
|
|
原始编号 |
原始编号 |
Original number |
文本 |
20 |
|
|
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|
收藏时间 |
收藏时间 |
Collection date |
日期 |
10 |
|
|
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|
|
培养基编号 |
培养基编号 |
Medium number |
文本 |
8 |
|
|
|
|
|
|
|
培养温度 |
培养温度 |
Incubate temperature |
数字 |
6 |
|
℃ |
|
|
|
|
|
资源归类编码 |
资源归类编码 |
Resource code |
数字 |
11 |
|
|
|
|
|
|
|
模式菌株 |
模式菌株 |
Type strain |
选择 |
12 |
|
|
1：模式菌株 2：非模式菌株 |
1：Type strain 2：Not type strain |
|
|
|
|
生物危害程度 |
生物危害程度 |
Risk group |
选择 |
8 |
|
|
1：一类 2：二类 3：三类 4：四类 5：不清楚 |
1：Group Ⅰ 2：Group Ⅱ 3：Group Ⅲ 4：Group Ⅳ 5：Unknown |
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|
分类地位 |
分类地位 |
Taxonomy |
文本 |
225 |
|
|
|
|
|
|
|
液体培养宏观特征 |
宏观特征 |
Macroscopical characteristic in liquid |
文本 |
225 |
|
|
|
|
|
|
|
细胞形状 |
细胞形状 |
Cell shape |
文本 |
100 |
|
|
|
|
|
|
|
细胞大小 |
细胞大小 |
Size of cell |
数字 |
30 |
2 |
μm |
|
|
|
|
|
无性繁殖方式 |
无性繁殖方式 |
Mode of asexual reproduction |
选择 |
20 |
|
|
1：芽殖 2：裂殖 3：芽裂殖 4：产生无性孢子 5：其他 |
1：budding 2：fission 3：bud-fission 4：produce asexual spores 5：other |
|
|
|
无性孢子的类型 |
无性孢子的类型 |
Type of asexual spore |
选择 |
20 |
|
|
1：芽生孢子 2：节孢子 3：厚垣孢子 4：掷孢子 5：内生孢子 6：其他 |
1：blastospore 2：arthrospore 3：chlamydospore 4：ballistospore 5：endospore 6：other |
|
|
|
菌落质地 |
菌落质地 |
Colony texture |
文本 |
100 |
|
|
|
|
|
|
|
菌落颜色 |
菌落颜色 |
Colony color |
文本 |
100 |
|
|
|
|
|
|
|
菌落表面 |
菌落颜色 |
Colony surface |
文本 |
100 |
|
|
|
|
|
|
|
菌落隆起 |
菌落隆起 |
Colony elevation |
文本 |
100 |
|
|
|
|
|
|
|
菌落边缘 |
菌落边缘 |
Colony margin |
文本 |
100 |
|
|
|
|
|
|
|
菌丝形态 |
菌丝形态 |
Hypha texture |
选择 |
20 |
|
|
1：真菌丝 2：假菌丝 |
1：true hyphae 2：pseudohyphae |
|
|
|
有性繁殖方式 |
有性繁殖方式 |
Mode of sexual reproduction |
选择 |
20 |
|
|
1：产子囊孢子 2：产冬孢子 3：其他 |
1：produce ascospore 2：produce teliospore 3：other |
|
|
|
子囊孢子的数量 |
子囊孢子的数量 |
Number of ascospores |
数字 |
2 |
0 |
个/子囊 |
|
|
|
|
|
子囊孢子的形状 |
子囊孢子的形状 |
Shape of ascospores |
选择 |
50 |
|
|
1：球形 2：卵圆形 3：圆锥形 4：肾形 5：礼帽形 6：土星形 7：针形 8：纺锤形 9：棒状 10：其他 |
1：globose 2：oviform 3：coniform 4：kidney-shaped 5：hat—shaped 6：saturnoid 7：needoe-shaped 8：spindle-shaped 9：club-shaped 10：other |
|
|
|
子囊孢子的大小 |
子囊孢子的大小 |
Size of ascospores |
数字 |
12 |
|
μm |
|
|
|
|
|
糖发酵试验 |
糖发酵试验 |
Fermentation of carbohydrates |
|
|
|
|
糖类发酵试验库 |
|
|
|
|
碳源同化试验 |
碳源同化试验 |
Assimilation of carbon compounds |
|
|
|
|
碳源利用库 |
|
|
|
|
氮源同化试验 |
氮源同化试验 |
Assimilation of nitrogen compounds |
|
|
|
|
氮源利用库 |
|
|
|
|
无维生素培养基生长状况 |
无维生素培养基生长状况 |
Growth in vitamin-free medium |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
依赖维生素特性实验 |
依赖维生素特性试验 |
Vitamin requirements |
|
|
|
|
维生素试验库 |
|
|
|
|
类淀粉化合物的形成 |
类淀粉化合物的形成 |
Formation of extracellular amyloid compounds |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
分解脂肪实验 |
分解脂肪实验 |
Splitting of fat |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
产酯实验 |
产酯实验 |
Ester production |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
产酸实验 |
产酸实验 |
Acid production |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
明胶液化实验 |
明胶液化实验 |
Gelatin liquefaction |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
尿素分解实验 |
尿素分解实验 |
Urea hydrolysis |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
高渗透压生长实验 |
高渗透压生长试验 |
Growth in media of high osmotic pressure |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
抗放线菌酮实验 |
抗放线菌酮实验 |
Cycloheximide resistance |
选择 |
50 |
|
|
1：在0.01%放线菌酮培养基中生长 2：在0.1%放线菌酮的培养基上生长 3：不生长 |
1：growth in 0.01% cycloheximide 2：growth in 0.1% cycloheximide 3：non-growth |
|
|
|
1%乙酸培养基中生长实验 |
1%乙酸培养基中生长实验 |
Tolerance of 1% acetic acid |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
温度实验 |
温度实验 |
Test on growth temperature |
数字 |
30 |
|
|
|
|
|
|
|
熊果苷裂解试验 |
熊果苷裂解试验 |
Splitting of arbutin |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
DBB试验 |
DBB试验 |
Diazonium Blue B color reaction |
选择 |
20 |
|
|
1：阴性 2：阳性 |
1：negative 2：positive |
|
|
|
G+C mol％ |
G+C mol％ |
G+C mol％ |
数字 |
30 |
|
|
|
|
|
|
|
核酸序列信息 |
核酸序列信息 |
Information of nucleic acid sequence |
文本 |
2000 |
|
|
|
|
|
|
|
营养缺陷型 |
营养缺陷型 |
Auxotroph |
文本 |
200 |
|
|
|
|
|
|
|
携带特定用途的基因元器件名称 |
携带特定用途的基因元器件名称 |
Gene for specifically use |
文本 |
200 |
|
|
|
|
|
|
|
核型信息 |
核型信息 |
Information of karyogram |
链接 |
|
|
|
图像库 |
|
|
|
|
辅酶Q类型 |
辅酶Q类型 |
Coenzyme Q structure |
文本 |
100 |
|
|
|
|
|
|
|
主要用途 |
主要用途 |
Main field of application |
数字 |
50 |
|
|
1：分类2：研究 3：教学4：生产 5：分析检测 6：其他 |
1：classification 2：research 3：teaching 4：production 5：analyse 6：other |
|
|
|
具体用途 |
具体用途 |
Specific application |
文本 |
200 |
|
|
|
|
|
|
|
主要代谢产物名称 |
主要代谢产物名称 |
Name of the main metabolism |
文本 |
100 |
|
|
|
|
|
|
|
致病对象 |
致病对象 |
Pathogenic object |
文本 |
100 |
|
|
|
|
|
|
|
致病名称 |
致病名称 |
Name of pathogenesis |
文本 |
100 |
|
|
|
|
|
|
|
图像信息 |
图像信息 |
Image information |
链接 |
|
|
|
图像库 |
|
|
|
|
文献信息 |
文献信息 |
Reference |
链接 |
|
|
|
文献库 |
|
|
|
|
数据源主键 |
数据源主键 |
Data key |
文本 |
9 |
|
|
|
|
|
酵母糖类发酵实验数据标准
|
序号 |
描述符 |
字段名 |
字段类型 |
字段长度 |
字段小数位 |
单位 |
代码 |
|
1 |
葡萄糖 |
Glucose |
|
|
|
|
|
|
2 |
半乳糖 |
Galactose |
|
|
|
|
|
|
3 |
蔗糖 |
Sucrose |
|
|
|
|
|
|
4 |
麦芽糖 |
Maltose |
|
|
|
|
|
|
5 |
乳糖 |
Lactose |
|
|
|
|
|
|
6 |
棉子糖 |
Raffinose |
|
|
|
|
|
|
7 |
海藻糖 |
Trehalose |
|
|
|
|
|
酵母碳源利用库数据标准
|
序号 |
描述符 |
字段名 |
字段类型 |
字段长度 |
字段小数位 |
单位 |
代码 |
|
1 |
D-葡萄糖 |
D-Glucose |
|
|
|
|
|
|
2 |
D-半乳糖 |
D-Galactose |
|
|
|
|
|
|
3 |
L-山梨糖 |
L-Sorbose |
|
|
|
|
|
|
4 |
D-氨基葡萄糖 |
D-Glucosamine |
|
|
|
|
|
|
5 |
D-核糖 |
D-Ribose |
|
|
|
|
|
|
6 |
D-木糖 |
D-Xylose |
|
|
|
|
|
|
7 |
L-阿拉伯糖 |
L-Arabinose |
|
|
|
|
|
|
8 |
D-阿拉伯糖 |
D-Arabinose |
|
|
|
|
|
|
9 |
L-鼠李糖 |
L-Rhamnose |
|
|
|
|
|
|
10 |
蔗糖 |
Sucrose |
|
|
|
|
|
|
11 |
麦芽糖 |
Maltose |
|
|
|
|
|
|
12 |
α，α-海藻糖 |
α，α-Trehalose |
|
|
|
|
|
|
13 |
甲基α-D-吡喃葡萄糖苷 |
Meα-D-glucoside |
|
|
|
|
|
|
14 |
纤维二糖 |
Cellobiose |
|
|
|
|
|
|
15 |
水杨苷 |
Salicin |
|
|
|
|
|
|
16 |
对苯二酚葡萄糖苷 |
Arbutin |
|
|
|
|
|
|
17 |
蜜二糖 |
Melibiose |
|
|
|
|
|
|
18 |
乳糖 |
Lactose |
|
|
|
|
|
|
19 |
棉子糖 |
Raffinose |
|
|
|
|
|
|
20 |
松三糖 |
Melezitose |
|
|
|
|
|
|
21 |
菊糖 |
Inulin |
|
|
|
|
|
|
22 |
淀粉 |
Starch |
|
|
|
|
|
|
23 |
甘油 |
Glycerol |
|
|
|
|
|
|
24 |
赤藻糖醇 |
Erythritol |
|
|
|
|
|
|
25 |
核糖醇 |
Ribitol |
|
|
|
|
|
|
26 |
木糖醇 |
Xylitol |
|
|
|
|
|
|
27 |
L- 阿拉伯糖醇 |
L-Arabinitol |
|
|
|
|
|
|
28 |
D-葡萄糖醇 |
D-Glucitol |
|
|
|
|
|
|
29 |
D-甘露糖醇 |
D-Mannitol |
|
|
|
|
|
|
30 |
半乳糖醇 |
Galactitol |
|
|
|
|
|
|
31 |
肌醇 |
myo-Inositol |
|
|
|
|
|
|
32 |
D-葡糖酸-1,5-内酯 |
D-Glucono-1,5-lactone |
|
|
|
|
|
|
33 |
2-酮-D-葡萄糖酸盐(或酯) |
2-Keto-D-Gluconate |
|
|
|
|
|
|
34 |
5-酮-D-葡萄糖酸盐(或酯) |
5-Keto-D-Gluconate |
|
|
|
|
|
|
35 |
D-葡萄糖酸盐(或酯) |
D-Gluconate |
|
|
|
|
|
|
36 |
D-葡糖醛酸 |
D-Glucuronate |
|
|
|
|
|
|
37 |
D-半乳糖醛酸 |
D-Galacturonic acid |
|
|
|
|
|
|
38 |
DL-乳酸盐 |
DL-Lactate |
|
|
|
|
|
|
39 |
琥珀酸盐（或酯） |
Succinate |
|
|
|
|
|
|
40 |
柠檬酸盐 |
Citrate |
|
|
|
|
|
|
41 |
甲醇 |
Methanol |
|
|
|
|
|
|
42 |
乙醇 |
Ethanol |
|
|
|
|
|
|
43 |
丙二醇 |
Propane 1,2 diol |
|
|
|
|
|
|
44 |
丁烷-1,2-二元醇 |
Butane 2,3 diol |
|
|
|
|
|
|
45 |
奎宁酸 |
Quinic acid |
|
|
|
|
|
|
46 |
D-葡萄糖二酸 |
D-glucarate |
|
|
|
|
|
|
47 |
D-半乳糖酸 |
D-Galactonate |
|
|
|
|
|
酵母氮源利用库数据标准
|
序号 |
描述符 |
字段名 |
字段类型 |
字段长度 |
字段小数位 |
单位 |
代码 |
|
1 |
硝酸盐 |
Nitrate |
|
|
|
|
|
|
2 |
亚硝酸盐 |
Nitrite |
|
|
|
|
|
|
3 |
乙胺 |
Ethylamine |
|
|
|
|
|
|
4 |
L-赖氨酸 |
L-Lysine |
|
|
|
|
|
|
5 |
戊二胺 |
Cadaverine |
|
|
|
|
|
|
6 |
肌氨酸 |
Creatine |
|
|
|
|
|
|
7 |
肌氨酸酐 |
Creatinine |
|
|
|
|
|
|
8 |
氨基葡萄糖 |
Glucosamine |
|
|
|
|
|
|
9 |
咪唑 |
Imidazole |
|
|
|
|
|
|
10 |
D-色氨酸 |
D-Tryptophan |
|
|
|
|
|
酵母维生素利用库数据标准
|
序号 |
描述符 |
字段名 |
字段类型 |
字段长度 |
字段小数位 |
单位 |
代码 |
|
1 |
对氨基苯甲酸 |
p-aminobenzoic acid |
|
|
|
|
|
|
2 |
生物素 |
Biotin |
|
|
|
|
|
|
3 |
叶酸 |
Folic acid |
|
|
|
|
|
|
4 |
肌醇 |
myo-inositol |
|
|
|
|
|
|
5 |
烟酸 |
Nicotinic acid |
|
|
|
|
|
|
6 |
泛酸钙 |
Pantothenate (Ca) |
|
|
|
|
|
|
7 |
盐酸吡哆醇 |
Pyridoxine HCl |
|
|
|
|
|
|
8 |
核黄素 |
Riboflavin |
|
|
|
|
|
|
9 |
盐酸硫胺素 |
Thiamin HCl |
|
|
|
|
|
