青霉属及其相关有性型属菌种资源描述规范
起草单位:中国食品发酵工业研究院
目 次
前 言............................................................................... 3
引 言............................................................................... 4
青霉属及其相关有性型属菌种资源描述规范................................................. 5
1 范围................................................................................. 5
2 规范性引用文件....................................................................... 5
3 术语和概念........................................................................... 5
4 要求................................................................................. 6
5 描述内容............................................................................. 6
附录1 标准或通用培养基成分............................................................ 10
1 查氏琼脂(Czapek agar, CA)......................................................... 10
2 查氏酵母膏琼脂(Czapek yeast exatract agar, CYA)................................... 10
3 麦芽汁琼脂(Malt extract agar, MEA)................................................ 10
4 燕麦琼脂(Oat mealt agar, OA)...................................................... 11
参考文献.............................................................................. 11
附表1青霉属及其相关有性型属菌菌种资源描述表.......................................... 12
前 言
本规范由国家自然科技资源平台建设项目提出。
本规范起草单位:中国农业科学院农业资源与农业区划研究所、中国科学院微生物研究所、中国林业科学研究院森林保护研究所、中国药品生物制品检定所、中国医学科学院医药生物技术研究所、中国兽医药品监察所、中国食品发酵工业研究院。
本规范主要起草人:程池、姚粟、李金霞、姜瑞波、顾金刚、周宇光、朴春根、叶强、张月琴、陈敏等。
引 言
青霉属及其相关有性型属菌种是一类重要的微生物菌种资源, 是微生物多样性的组成部分,为真菌学研究、教学及生物技术产业持续发展提供菌种资源。青霉属及其相关有性型属菌种具有重要的经济意义,不仅是有机酸和抗生素工业的重要菌种来源之一,同时也是造成工业产品、食品、饲料和其他物质严重霉腐、污染的菌物,有些是人和动物的致病菌。
制定本规范是为了规范青霉属及其相关有性型属菌种资源描述,便于青霉属及其相关有性型属菌种资源的收集、保存、鉴定、评价、研究和利用,有效整理菌种资源,促进菌种资源信息化,实现菌种资源的高效共享和可持续利用。
青霉属及其相关有性型属菌种资源描述规范
1 范围
本规范规定了青霉属及其相关有性型属菌种资源描述要素和描述要求。
本规范适用于青霉属及其相关有性型属菌种资源的收集、鉴定、整理、保藏,以及数据库和信息共享网络系统的建立。
2 规范性引用文件
下列文件中的条款通过本标准的引用而成为本标准的条款。凡是注日期的引用文件,其随后所有的修改单(不包括勘误的内容)或修订版均不适用于本标准,然而,鼓励根据本标准达成协议的各方研究是否可使用这些文件的最新版本。凡是不注日期的引用文件,其最新版本适用于本标准。
《病原微生物实验室生物安全管理条例》国务院令第424号
《自然科技资源共性描述规范》科技部自然科技资源平台联合管理办公室文件
《微生物菌种资源采集环境描述规范》
3 术语和概念
下列术语和概念适用于本规范。
3.1 青霉属 Penicillium Link
青霉属菌种菌丝细、无色或有颜色,具横隔,产生大量不规则分枝;分生孢子梗由基内、表面或气生型菌丝生出,通常单生,少数种的分生孢子梗彼此紧贴或融合而形成孢梗束或束丝;孢梗茎较细,常具隔膜,部分种在其顶端呈现不同程度的膨大,壁光滑或呈现不同程度的粗糙;帚状枝单轮生,两轮生,三轮生,四轮生和不规则生等;产孢细胞瓶梗相继产生,瓶状,披针形,有些圆柱状或近圆柱状者;分生孢子是向基生的瓶梗孢子,呈球形、近球形、椭球形、近椭球形、圆柱形、梨形或梭形,单胞,壁光滑或不同程度的粗糙,且使菌落表面形成不同程度的各种蓝绿或黄绿色。
3.2 正青霉属 Eupenicillium Ludwig
子囊果是无孔的闭囊壳,其包被由多角形的拟薄壁细胞组成,质地坚硬或较坚硬,通常球形或近球形,少数近椭圆形或椭圆形者少;原基是产囊丝发育成的菌丝节;子囊单生,链生,也有两者同时存在者,球形或近球形至椭球形,不规则排列,每个通常含8个子囊孢子;子囊孢子通常呈现双凸透镜形,不规则排列,单细胞,通常有明显或不明显的赤道脊或冠、或赤道沟,壁平滑或有不同的纹饰。
3.3 篮状菌属 Talaromyces Benjamin
子囊果是裸囊壳,其包被由纤细菌丝交织而成,质地从疏松至紧密,依种而定,球形、近球形或近椭圆形;原基多样,有螺旋状、棒状、菌丝膨大且弯曲或更复杂的形状;子囊链生、单生,少数不规则生,球形、近球形或椭圆形,不规则排列,每个通常含8个子囊孢子;子囊孢子球形、近球形或椭圆形,透明、黄色、少数带红色,单细胞,壁平滑或有不同的纹饰。
3.4 分类系统 Taxonomy
本规范建议参照Pitt(1979)的分类系统,他主要按帚状枝的分枝情况将其分为四个亚属:类曲霉亚属(Subgenus Aspergilloides)、青霉亚属(Subgenus Penicillium)、双轮亚属(Subgenus Biverticillium)和叉状亚属(Subgenus Furcatum),共10组21系。
3.5 分类 Classification
青霉属:半知菌亚门(Deuteromycotina),丝孢菌纲(Hyphomycetes),丝孢目(Hyphomycetales),从梗孢科(Moniliaceae),青霉属(Penicillium);
有性型属:子囊菌亚门(Ascomycotina),不整子囊纲(Plectomyces),散囊菌目(Eurotiales),发菌科(Trichocomaceae),正青霉属(Eupenicillium)和篮状菌属(Talaromyces)
4 要求
4.1 描述要求:
—— 描述内容应清楚、准确,力求完整;
—— 描述文体和术语应保持一致;
—— 要充分考虑该菌株的最新研究进展;
—— 能被微生物专业人员理解。
4.2 描述要素
描述要素分为3类:
—— M:必备要素,必须描述的要素。
—— O:可选要素,其描述与否视具体菌株而定。
—— M或O:已有或容易获得的要素必须描述;很难或无法获得的要素可不描述。
5 描述内容
5.1 基本信息
5.1.1 平台资源号(M)
平台资源号长度为18位,前9位是资源单位编码,后9位是流水号,具体编写规则见《自然科技资源共性描述规范》。
5.1.2 菌株保藏编号(M)
应描述该菌株在保藏机构的保藏编号,由前缀和菌株编号两部分组成。前缀为保藏机构名称的英文缩写,前缀和菌株编号之间留半角空格。
5.1.3 中文名称(M)
应描述该菌株的中文名称(如有异名,可在括号中注明)。尚无中文译名者,填写“暂无”。
5.1.4 学名(M)
应描述该菌株完整的科学名称。对于鉴定到属,未鉴定到种的菌株,种名以“sp.”表示。
5.1.5 其它保藏中心编号(O)
宜描述该菌株在其它菌种保藏中心的保藏编号。其它保藏中心的编号由“=”开头,保藏编号之间用“=”连接。
5.1.6 来源历史(M)
应描述该菌株在收藏单位之间的转移情况。收藏单位以前左指向箭头“←”开始,收藏单位之间用“←”连接。
5.1.7 收藏时间(M或O)
应描述该菌株被保藏机构收集、保藏的时间。格式为YYYYMMDD,其中YYYY为年,MM为月,DD为日。
5.1.8 原始编号(M或O)
应描述该菌株的原始分离编号。
5.1.9 原产国 (M或O)
应描述该菌株分离基物采集地所在国家名称。
5.1.10 分离人(M或O)
应描述该菌株原始分离人的姓名。
5.1.11 分离时间(M或O)
应描述该菌株的原始分离时间。
5.1.12 干标本号(O)
如果该菌株有干标本,宜描述其标本保藏机构及保藏编号。
5.1.13 鉴定人(M或O)
应描述该菌株的鉴定人。
5.1.14 鉴定人所在单位(M或O)
应描述该菌株的鉴定人所在单位。
5.1.15 分离基物(M或O)
应描述该菌株分离物质的具体名称,对于寄生或共生的宜描述分离的具体组织部位。
5.1.16 采集地(M或O)
应描述分离基物的采集地区和采集地点。
5.1.17 采集地生境(O)
宜描述该菌株分离基物采集具体地点的生态环境,参照《微生物菌种资源采集环境描述规范》。
5.1.18 生物危害程度(M)
应描述该菌株的生物危害程度,其分类方法参照《病原微生物实验室生物安全管理条例》。
1:一类
2:二类
3:三类
4:四类
5:不清楚
5.1.19 模式菌株(M)
应描述该菌株是否是模式菌株。
1:模式菌株
2:非模式菌株
5.1.20 分类地位 (M)
应描述该菌株的界、门、纲、目、科、属、种。
如需要,可描述该菌株的变种、亚种、专化型、融合种名称及生理小种类型等。
5.2 特征特性信息
菌株形态学性状描述中,对颜色的描述通常先以常识性的颜色描述,然后再加上色谱上的具体颜色名称,如Ridgway (1912)《Color standards and Color nomenclature》,Kornerup & Wanscher (1967;1978)的《The Methuen Handbook of Colour》或Rayner(1970)《A Mycological Colour Chart》。显微性状测量大小时,球形和半球形者测量其直径,以直径范围表示,单位为µm;其他形状需测其长度和直径,以长度范围×直径范围表示,单位为µm。
5.2.1 标准(或通用)培养条件(M)
描述青霉属及其相关有性型属菌种的形态学性状时,应注明所采用的标准(或通用)培养条件。标准(或通用)培养条件包括标准培养基、培养温度及培养时间。标准培养基为:查氏琼脂(Czapek agar, CA)、查氏酵母膏琼脂(Czapek yeast exatract agar, CYA)、麦芽精琼脂(Malt extract agar, MEA)、25%甘油硝酸盐琼脂(25% Glycerol nitrate agar, G25N)和燕麦琼脂(OA);培养温度为5℃、25℃和37℃;通常在CA上培养12天,发育迟缓的菌株在前述条件下培养7天时不形成或极少形成分生孢子结构,要适当延长培养时间;如果想获得子囊菌,在分离时,可将分离样品放置水浴中,60℃加温30min。
5.2.2 菌落直径(M)
应描述该菌株菌落直径,从菌落背面测量,单位为mm。
5.2.3 菌落颜色(M)
菌落颜色主要是分生孢子(分生孢子链)和菌丝体的颜色组成,应描述菌落颜色。
5.2.4 菌落厚薄(O)
菌落的厚薄宜描述其深度(depth),单位为mm。
5.2.5 菌落表面(O)
菌落表面可能平坦,或有不同程度的规则或不规则的放射状皱纹、沟纹、突起或凹陷等,还有的分离物具有同心环纹。宜描述菌落表面情况。
5.2.6 菌落质地(M)
菌落质地通常可以肉眼观察或借助低倍显微镜观察,主要分为五种类型:绒状、絮状、绳状、颗粒状和粉末状。应描述菌落质地的类型。
5.2.7 渗出液(M或O)
渗出液是菌株在菌落表面渗出的液滴,可能无色或有不同的颜色。应描述菌株是否产生液滴,以及产生液滴的颜色。
5.2.8 可溶性色素(M或O)
有些菌株产生不同程度的可溶性色素并扩散至培养基,有各种不同的颜色。应描述菌株是否产生可溶性色素,以及产生可溶性色素的颜色。
5.2.9 菌落反面颜色(M)
菌落反面颜色通常是基内菌丝体及其产生的色素的颜色,可能无色或呈现不同颜色。应描述菌落反面的颜色。
5.2.10 分生孢子梗(M)
分生孢子梗即产生分生孢子的全部结实结构(不包括分生孢子),由孢梗茎和帚状枝组成。应描述分生孢子梗的来源,如发生(或产生)于基质、表面菌丝、气生菌丝和绳状菌丝,因分离物而有所不同。
5.2.11 孢梗茎(M)
应描述孢梗茎的大小以及壁表面是否平滑或粗糙和粗糙程度。
5.2.12 帚状枝(M)
帚状枝由副枝、类副枝、梗基及瓶梗4个部分组成,最简单的帚状枝只有瓶梗轮,最复杂者包括4个部分。应描述帚状枝各组成部分的数目、大小及壁是否光滑或粗糙;瓶梗和有特点的梗基要描述其形状;还要描述帚状枝各部分彼此之间是否紧密和叉开的程度等。
5.2.13 分生孢子(M)
分生孢子是产孢细胞产生的一种特化而不动的无性孢子,单细胞;单个孢子球形、近球形、卵圆形、椭圆形、洋梨形、近椭圆形、圆柱形或近圆柱形,其壁光滑或呈现不同程度的粗糙。应描述分生孢子的形状、大小以及壁表面的粗糙程度。
5.2.14 菌核(O)
某些菌种产生菌核,菌核由厚壁的拟薄壁细胞组成,较硬或很硬,形状通常为球形、近球形或椭圆形等;颜色可能是无色或近于无色,粉红色或棕褐色等。宜描述菌核形状、大小和颜色。
5.2.15 闭囊壳(M)
闭囊壳为有明确完整的包被(壁)而无孔的子囊果,其壁由不规则的多角形拟薄壁细胞组成,通常为球形或近球形;其颜色分别为粉红色、粉红褐色、黄褐色、暗褐色、橄榄褐色、淡黄色、橘黄色或近灰色等。应描述闭囊壳大小和颜色。
5.2.16 子囊(M)
子囊是生于子囊果内的囊状体,链生或单生,多为球形或近球形,每个子囊通常内含8个子囊孢子,应描述子囊单生还是链生、形状、大小和含有子囊孢子数量。
5.2.17 子囊孢子(M)
正青霉的子囊孢子呈现双凸镜状,椭圆形或近球形;通常有两个赤道脊或冠,彼此紧贴或不同程度的分开,也有缺乏或仅有脊的痕迹者;子囊孢子壁平滑或呈现刺状、网纹状或不规则的肋状。篮状菌的子囊孢子通常呈现不同程度的椭圆形,也有球形或近球形者;表面平滑或呈现不同程度的粗糙;无色或黄色。应描述子囊孢子形状、大小、颜色和表面粗糙程度。
5.2.18 裸囊壳(M)
篮状菌属的子囊果是裸囊壳,其包被是由菌丝经不同程度的疏松交织而成,此性状是与正青霉属相区分的主要性状。其形状主要是球形或近球形,呈现不同程度的黄色、黄褐色、粉红色或紫色等。应描述裸囊壳形状、大小和颜色。
5.2.19 培养基编号(M)
应描述该菌株最适培养基的统一编号,由前缀和培养基编号两部分组成。前缀为统一培养基编号的英文缩写CM,编号以4位数字表示,前缀和编号之间不留空格,培养基的统一编号参照《中国菌种目录》。
5.2.20 温度 (M)
应描述该菌株生长的最适温度、最高温度及最低温度,以℃表示。
5.2.21 pH值 (O)
宜描述该菌株生长最适pH值、最高pH及最低pH值。
5.2.22 生长速度 (O)
宜描述菌株的生长速度,以单位时间内菌落直径大小表示,长度单位一般用mm表示,时间单位以d表示,并描述培养基编号(或配方)以及相应的培养条件。
5.2.23 生理生化特性 (O)
宜描述该菌株特有的生理、生化特性。
5.2.24 特殊遗传标记 (O)
对于具有特殊遗传标记的菌株,宜描述其具体的遗传标记信息。
5.2.25 核苷酸序列信息 (O)
宜描述该菌株的核苷酸序列信息,如ITS1-5.8 S-ITS2序列信息等,并注明核苷酸序列注册号。
5.2.26 菌株用途 (O)
宜描述该菌株已知的主要用途及功能特性。
5.2.27 致病对象 (O)
宜描述病原菌种的致病对象类群。
1:人
2:动物
3:人畜共患
4:植物
5:微生物
6:无
7:不清楚
5.3 其它信息
5.3.1 图象信息 (O)
宜描述该菌株的菌落、孢子、产孢结构、组织等图象信息。
5.3.2 文献信息(O)
宜列出该菌株公开发表的文献资料。
5.3.3 保存方法 (M)
应描述适合该菌株长期保藏的技术方法。
附录1 标准或通用培养基成分
1 查氏琼脂(Czapek agar, CA)
查氏浓缩液 10ml
K2HPO4 1.0g
蔗糖 30g
琼脂 17.5g
蒸馏水 1000ml
查氏浓缩液配方:
NaNO3 30g
KCl 5g
MgSO4.7H2O 5g
FeSO4.7H2O 0.1g
ZnSO4.7H2O 0.1g
CuSO4.5H2O 0.05g
蒸馏水 100ml
2 查氏酵母膏琼脂(Czapek yeast exatract agar, CYA)
K2HP O4 1g
查氏浓缩液 10ml
酵母抽提物 5g
蔗糖 30g
琼脂 15g
蒸馏水 1000ml
3 麦芽汁琼脂(Malt extract agar, MEA)
麦芽抽提粉 20g
蛋白胨 1g
葡萄糖 20g
琼脂 15g
蒸馏水 1000ml
25%甘油硝酸盐琼脂(25% Glycerol nitrate agar, G25N)
K2HP O4 0.75g
查氏浓缩液 7.5ml
酵母抽提粉 3.7g
甘油(分析纯) 250g
琼脂 12g
蒸馏水 750ml
4 燕麦琼脂(Oat mealt agar, OA)
将20g商品燕麦片放入1000ml水中,煮沸30min后,用纱布过滤。过滤后使滤液达到最初的体积1L,然后加入20g琼脂。
参考文献
[1] Alexopoulos CJ, Blackwell M, Mims CW. 菌物学概论. 姚一建, 李玉等译. 北京: 中国农业出版社, 2000
[2] Pitt JI. The Genus Penicillium and its teleomorphic states Eupenicillium and Talaromyces. New York: Academic Press INC. 1979
[3] Raper KB, Fennell DI. A Manual of the Penicillia. Illinois: The Williams & Wilkins Company. 1949
[4] Prescott LM, Harley JP, Klein DA. Microbiology. Fifth Edition. Columbus: McGraw-Hill Companies. 2002
[5] Kirk PM, Cannon PF, David JC, Stalpers JA. Dictionary of the fungi. 9th edition. UK: CABI Bioscience. 2001
[6] 邢来君,李明春. 普通真菌学. 北京: 高等教育出版社,1999
[7] 小型丝状真菌菌种资源描述规范(内部资料2004制定). 微生物平台建设项目组.
[8] 中国科学院微生物研究所. 菌种保藏手册. 北京:中国轻工业出版社,1980
[9] 周德庆. 微生物学教程. 北京:高等教育出版社,1993
[10] 中国微生物菌种保藏管理委员会. 中国菌种目录. 北京:机械工业出版社,1992
附表1青霉属及其相关有性型属菌菌种资源描述表
填表日期: 年 月 日
基本信息 |
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平台资源号 |
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菌株保藏编号 |
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中文名称 |
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学名 |
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其它保藏中心编号 |
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来源历史 |
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收藏时间 |
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原始编号 |
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原产国 |
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分离人 |
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分离时间 |
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干标本号 |
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鉴定人 |
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鉴定人所在单位 |
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分离基物 |
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采集地 |
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采集地生境 |
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生物危害程度 |
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模式菌株 |
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分类地位 |
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特征特性信息 |
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标准(或通用)培养条件 |
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菌落直径 |
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菌落颜色 |
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菌落厚薄 |
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菌落表面 |
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菌落质地 |
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渗出液 |
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可溶性色素 |
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菌落反面颜色 |
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分生孢子梗 |
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孢梗茎 |
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帚状枝 |
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分生孢子 |
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菌核 |
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闭囊壳 |
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子囊 |
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子囊孢子 |
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裸囊壳 |
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培养基编号 |
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温度 |
最高________℃; 最适________℃; 最低________℃ |
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pH值 |
最高________ 最适________ 最低________ |
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生长速度 |
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生理生化特性 |
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特殊遗传标记 |
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核苷酸序列信息 |
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菌株用途 |
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致病对象 |
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其它信息 |
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图象信息 |
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文献信息 |
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保存方法 |
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