嗜热链球菌（Streptococcus thermophilus）作为乳制品发酵剂核心菌种，在酸奶等发酵乳制品的生产中被广泛应用。然而，其分类学地位几经变更，目前在学术和产业领域存在“嗜热链球菌”和“唾液链球菌嗜热亚种”两种分类学名称同时使用的情况。嗜热链球菌已被我国、欧美、国际乳品联合会（IDF）等收录为食品用菌种，对微生物开展科学分类地位的确认，是菌株功能深入研究、产业化应用、企业申报和政府监管的重要前提。

1919年：嗜热链球菌（S. thermophilus）最初由Orla-Jensen在1919年通过传统DNA-DNA杂交方法提出。

1984年：Farrow等人基于DNA-DNA杂交结果将其分类变迁为唾液链球菌嗜热亚种（Streptococcus salivarius subsp. thermophilus）。

1991年：Schleifer等人根据严格条件下的DNA-DNA杂交结果，提出重新恢复嗜热链球菌（S. thermophilus）种水平分类。

目前，原核生物名称名录LPSN（List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature）中该菌种的正确分类学名称（correct name）为嗜热链球菌（S. hermophilus），唾液链球菌嗜热亚种（S. salivatius subsp. thermophilus）为该菌种的同物异名（synonym）。

近期，中国食品发酵工业研究院中国工业微生物菌种保藏管理中心（CICC）团队联合国际乳品联合会（IDF）技术专家，开展了关于嗜热链球菌的分类学地位研究。团队采用全基因组平均核苷酸序列一致性（ANI）和数字DNA-DNA杂交（dDDH）技术，结合基于16S rRNA基因、持家基因和全基因组核心基因系统发育分析等生物信息学分析手段，从基因层面和基因组层面对嗜热链球菌和唾液链球菌的亲缘关系进行了研究。研究结果显示嗜热链球菌与唾液链球菌为两个独立的物种，明确了嗜热链球菌Streptococcus thermophilus为正确分类学名称。

研究成果《基因组学研究支持嗜热链球菌和唾液链球菌为不同的物种》（Genomic insights support the taxonomic differentiation of Streptococcus thermophilus Orla-Jensen 1919 (Approved Lists 1980) and Streptococcus salivarius Andrewes and Horder 1906 (Approved Lists 1980) as individual species）[1] 于2025年1月在国际微生物分类学权威期刊《国际微生物学系统与进化杂志》（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology，IJSEM）发表。该研究为国际乳品联合会（IDF）第五版《发酵食品用菌种名单》中嗜热链球菌分类学地位更新[2]提供了有效依据，将为嗜热链球菌的科学使用、产业化推广及行业监管等提供科学基础，助力行业规范发展。

中国食品院CICC作为国家级菌种保藏管理与科技服务机构，面向国内外工业领域提供微生物资源的收集、保藏、鉴定、评价、进出口、研究开发和交流培训。中心保藏工业菌种资源1.4万余株，涵盖570余个属，1490余个种，搭建了完善的微生物精准鉴定与特征评价技术平台，通过ISO 9001、ISO 17025、CMA认证认可，检测数据国际互认。致力于推动工业微生物菌种的高水平自立自强和产业化应用，赋能生物制造及大健康产业的高质量发展。

参考文献

[1] Tang T, Liu Y, Cao Y, Cheng K, Lindsay D, Bourdichon F, Dubois-Lozier A, Bassett S, Xu Y, Feng H, Song Z, Liu R, Guo L, Yao S. Genomic insights support the taxonomic differentiation of Streptococcus thermophilus Orla-Jensen 1919 (Approved Lists 1980) and Streptococcus salivarius Andrewes and Horder 1906 (Approved Lists 1980) as individual species. Int J Syst Evol Microbiol, 2025, 75(1):006612. doi: 10.1099/ijsem.0.006612. PMID: 39836464.

[2] Federation ID. IDF position paper on clarifying taxonomy of dairy starter culture Streptococcus thermophilus. 2024.